La biblioteca del liceo scientifico Farnesina nasce sotto forma di biblioteche di classe in cui gli stessi insegnanti depositavano i libri utilizzati nella didattica, acquistati con fondi ricavati da autotassazione. Successivamente sono stati allestiti appositamente due spaziosi e luminosi locali, per soddisfare le rinnovate esigenze di una scuola vivace e impegnata in un costante processo di innovazione. 
Negli ultimi anni, a seguito di mirati piani di acquisto e donazioni varie, il numero di documenti della biblioteca del liceo scientifico Farnesina si è più che raddoppiato, ammontando attualmente più di 7000 unità, costituite in netta prevalenza da libri, con un discreto fondo di audiovisivi e qualche collana di cd-rom.
L’abbonamento alle principali riviste di attualità e divulgazione scientifica, ma anche di storia ed inglese, consente di soddisfare le esigenze di aggiornamento e le curiosità di docenti e studenti. Dall’ a. s. 1999-2000, infatti, il Collegio docenti ha sostenuto la cura ed il rilancio della biblioteca affidandola ad una docente responsabile supportata da una Commissione; si occupano dell’apertura e della gestione del servizio i docenti ed una impiegata di segreteria appositamente incaricata dal Preside, formata dalle docenti della commissione.
